Ziekten en erfelijke aandoeningen

Door hun schrikachtigheid springen wateragamen, met name wildvangexemplaren, bij een vluchtpoging vaak tegen de terrariumruit. Hierbij ontstaan vaak wonden aan de bek die gemakkelijk kunnen ontsteken. Als het terrarium goed schoon wordt gehouden, genezen deze wonden echter meestal goed.
Groene wateragamen zijn gevoelig voor verschillende inwendige en uitwendige parasieten, zoals darmparasieten en mijten. Daarom is het verstandig de ontlasting van nieuw aangekochte dieren te laten onderzoeken door een dierenarts en de dieren eerst tenminste een maand in een quarantainebak te plaatsen voordat ze samen met de andere agamen worden gehuisvest.
Een koude, zieke, gestreste of angstige wateragame kan van kleur veranderen, van lichtgroen tot bijna zwart. Behalve kleurverandering kunnen onder andere ook verminderde eetlust, vermagering, afwijkende ontlasting en lusteloosheid tekenen zijn van ziekte. Raadpleeg in die gevallen op korte termijn een dierenarts en neem zo vers mogelijke ontlasting van de dieren mee. De ontlasting kan eventueel korte tijd in de koelkast worden bewaard.
Door een tekort aan kalk en/of vitamine D3 kan bij terrariumdieren rachitis ontstaan, een aandoening met weke botten die gemakkelijk vervormen en breken. De dieren kunnen dan niet meer goed bewegen en dus geen prooien meer vangen. Als eenmaal verschijnselen van rachitis zijn ontstaan, is genezing niet meer mogelijk. Een goed vitaminen- en mineralenmengsel om de voedseldieren mee te bepoederen is dus van levensbelang.