De ooievaar broedt niet in Egypte.

Trek

Egypte is een belangrijke schakel op de trekroute van de oostelijke ooievaars. In de herfst komen de ooievaars Egypte binnen via het centrale en oostelijke deel van Sinai.
 Slechts heel weinig vogels volgen de kust van de Middelandse Zee en passeren het Suez kanaal. De grote massa vliegt door het oosten van Sinai en steekt de Rode Zee over ter hoogte van El Tor.

Op sommige dagen komen grote groepen ook zuidoostelijker terecht in de buurt van Sharm El Sheikh en Ras Mohammed.
Op het Egyptische vasteland vliegen de ooievaars via Qena naar de Nijl en blijven de rivier naar het zuiden volgen.

In het najaar trekken minstens 500.000 ooievaars door Egypte.

In het voorjaar volgen de ooievaars grotendeels dezelfde route langs de Nijl, die ze verlaten ter hoogte van Qena om door te vliegen naar de Rode Zee die ze oversteken in de zone van het zuidelijke Hurghada tot het noordelijke El Tor.

Jonge, onervaren vogels en verzwakte individuen blijven de Nijl ook noordelijk van Qena volgen en trachten te overzomeren in de delta van de Nijl.

Overwintering

Slechts een klein aantal ooievaars overwintert in Egypte.
De grootste aantallen worden geteld op de vuilnisbelt in Sharm El Sheikh (Sinai).