De laatste Alpenrit ging van start in Saint-Jean-de-Maurienne en eindigde 200,5km verder in Morzine na een 12km lange afdaling van de Joux-Plane. Het peloton moest de volgende bergen overwinnen: Col des Saisies (Cat.1), Col des Aravis (Cat.2), Col de la Colombière (Cat.1), Côte de Chatillon (Cat.3) en de Col de Joux-Plane (Buiten cat.).
Na zo'n 17km raakten elf renners voorop: Gilbert (La Française des Jeux) , Padrnos (Discovery Channel), O'Grady (CSC), Sinkewitz (T-Mobile), Righi (Lampre), Augé (Cofidis), Paolini (Liquigas), Le Mével en Halgand (Crédit Agricole), Tankink en Garate (QuickStep-Innergetic).
Bij de favorieten opende Floyd Landis (Phonak) de debatten al op de Col des Saisies nadat zijn ploeg berewerk had verzet in de aanloop er naartoe. Pereiro (Caisse d'Epargne-Illes Balears) kon de versnelling van de Amerikaan niet aan. Rogers en Klöden (T-Mobile) bleven het langste bij Landis, maar toen die een tweede keer zijn tempo verhoogde, moesten ook zij passen. Vooraan was het Halgand die solo ging.
Landis liep alsmaar meer uit op het peloton en kwam steeds dichter bij de kopgroep. Hij sloot aan bij hen net voor de tweede beklimming van de dag. Na die col ontstond een koptrio: Landis, Sinkewitz en de ingelopen Halgand.
Op de Col de la Colombière wisselde Landis van fiets. Even later moest Halgand vooraan afhaken. Sinkewitz en Landis hadden een voorsprong van meer dan 8' op de groep met de gele trui en zo werd hij in de afdaling virtueel leider. Omdat in deze Tour elke seconde telt, had hij onderweg al enkele bonificatieseconden meegegraaid.
Na de Colombière bepaalde CSC het tempo in de groep der favorieten. Zo wilde men stap voor stap aan de voorsprong van Landis knagen.
24km van Morzine werd de beklimming van de Joux-Plane ingezet. Landis begon daaraan met een voorsprong van om en bij de 8'. En Landis verzwakte niet. Sinkewitz moest de ex-gele truidrager al snel laten gaan. Achteraan werd het gauw te zwaar voor Leipheimer (Gerolsteiner), Rogers (T-Mobile) en de Discovery's die nog in het groepje zaten. Onder hen ook George Hincapie. Schleck (CSC) verhoogde het tempo en nam enkele meters voorsprong met z'n ploegmaat Sastre. Die ging er dan alleen vandoor. Hetzelfde scenario als de dag voordien. Achter Sastre volgde Moreau (AG2R) met Evans (Davitamon-Lotto), hij zou later nog een stuk terugvallen. Het groepje daarachter bestond uit Schleck, Cunego (Lampre), Menchov en Boogerd (Rabobank). Klöden had het zichtbaar moeilijk en Pereiro probeerde hem af te schudden, wat echter niet zou lukken.
Landis kwam als eerste in Morzine aan. En in het klassement staat hij opnieuw tussen de mensen. Enkel Sastre kon tijdens de beklimming wat van de voorsprong afdoen, maar het groepje Pereiro niet. Hij houdt wel nog de gele trui. Cunego is de nieuwe leider in het jongerenklassement. In de afdaling van de Joux-Plane ging Dessel (AG2R) uit de bocht, maar hij kon zijn tocht verder zetten.